נקבת חדקונית הדקל מטילה מאות ביצים בתוך סדקים וחורים קטנטנים בגזע העץ. כעבור ימים ספורים בלבד בוקעים זחלים לבנים ורכים המתחילים לכרסם את רקמות העץ הפנימיות. בשלב זה קשה מאוד לאתר את החדקונית מבחוץ, משום שהעץ והמעטפת שלו נראים בריאים אך למעשה העץ נפגע מבפנים.
הזחלים מתפתחים בתוך הדקל במשך מספר חודשים, ולאחר מכן מתגלמים (הופכים לגולם) והופכים לחיפושיות בוגרות שממשיכות את מחזור החיים. תהליך זה יכול לחזור על עצמו כמה פעמים בשנה, מה שמסביר את עוצמת הנזק והקושי בשליטה על ההתפשטות.